基因缺失不是基因突變，基因缺失是染色體缺失，屬于染色體結(jié)構(gòu)變異。
缺失是指染色體上某一區(qū)段及其帶有的基因一起丟失，從而引起變異的現(xiàn)象。
簡單來講，如果把基因比作一個(gè)學(xué)生，那么染色體大概就是一個(gè)班級(jí)，基因組就相當(dāng)于一個(gè)學(xué)校。
首先，從分子水平上來看，基因突變就是DNA分子上發(fā)生堿基改變。突變的原因可能來自于遺傳過程中復(fù)制的自發(fā)性改變，稱為自發(fā)突變。也可能通過一些物理或化學(xué)手段的處理使DNA發(fā)生突變，這種人工手段引起的DNA突變，稱為誘變。
其次，對(duì)于兩者而言，基因突變可以是DNA分子中堿基對(duì)的增添、缺失和替換所引起的基因結(jié)構(gòu)的改變。染色體變異包含缺失、重復(fù)、倒位、易位。
最后，兩者的不同點(diǎn)有以下兩點(diǎn)：第一點(diǎn)是新基因的產(chǎn)生?；蛲蛔冎皇侵窪NA分子中發(fā)生的堿基對(duì)的替換、添增和缺失從而引起的基因結(jié)構(gòu)的突變，可以產(chǎn)生新基因。染色體缺失可以說是染色體變異，不會(huì)引起基因的變化，也就是不會(huì)有新基因產(chǎn)生。
第二點(diǎn)是變異的范圍。基因突變是局部、小范圍的變異，染色體的結(jié)構(gòu)變異是指更大范圍的變異。