胃腸間質(zhì)瘤的預(yù)后總體要比胃癌的預(yù)后好得多。 一些低危的胃腸間質(zhì)瘤患者手術(shù)以后就可以認(rèn)為是治愈，不需要進(jìn)行靶向藥物治療，每年或每半年復(fù)查一次就可以了，在靶向藥物應(yīng)用以前一些中高危的胃腸間質(zhì)瘤患者的五年存活率平均是66個(gè)月，五年存活率是50%多一點(diǎn)，靶向藥物伊馬替尼問世以后胃腸間質(zhì)瘤的五年存活率大幅度的提高，口服一年的靶向藥物伊馬替尼，五年存活率能達(dá)到82.2%，口服五年 三年靶向藥物伊馬替尼的患者的五年存活率能達(dá)到90%多，從這些數(shù)字就可以看出胃腸道間質(zhì)瘤的預(yù)后是非常好的，尤其是在靶向藥物伊馬替尼問世以后，極大地改善了患者的生存，提高了生存率。

降低胃腸間質(zhì)瘤術(shù)后的復(fù)發(fā)率主要有兩個(gè)方面： 1、手術(shù)過程中要保證完整切除，不破裂，切緣是陰性，所以對(duì)一些巨大的胃腸間質(zhì)瘤患者要進(jìn)行術(shù)前治療，也就是術(shù)前口服靶向藥物，達(dá)到縮小腫瘤，避免術(shù)中破裂，減少術(shù)中出血和風(fēng)險(xiǎn)的目的，這樣也可以保證切緣的陰性； 2、對(duì)一些高危的胃腸間質(zhì)瘤患者和中危的胃腸間質(zhì)瘤患者，術(shù)后要進(jìn)行靶向藥物治療，首先選取一線靶向藥物伊馬替尼治療，研究發(fā)現(xiàn)對(duì)于一些高危的胃腸間質(zhì)瘤患者口服三年的靶向藥物的效果要遠(yuǎn)大于口服一年的，靶向藥物治療的患者，口服三年的中高危的，靶向藥物的胃間質(zhì)瘤的患者的五年存活率可能達(dá)到83%左右，而口服一年的靶向藥物的患者五年存活率要低于這些口服三年的靶向藥物治療的患者。

小間質(zhì)瘤是指一些＜2cm的胃間質(zhì)瘤，＜1cm的胃間質(zhì)瘤，叫微小間質(zhì)瘤，大量的研究發(fā)現(xiàn)大約20%的人群有小間質(zhì)瘤和微小間質(zhì)瘤，而這些人群大部分沒有處理，腫瘤與人群共生也沒有出現(xiàn)臨床癥狀。 而對(duì)于一些小間質(zhì)瘤來說如果胃鏡發(fā)現(xiàn)有一些不良因素，比如邊界不規(guī)整、有潰瘍、異質(zhì)性和強(qiáng)回聲，具有這些不良因素的，胃間質(zhì)瘤患者要積極的手術(shù)治療，雖然這些患者沒有臨床癥狀。 而對(duì)于一些有臨床癥狀，比如上腹不適、疼痛等這些癥狀的患者，也要進(jìn)行積極的手術(shù)治療，還有一部分患者病變位于特殊部位，比如胃食管結(jié)合部、直腸、十二指腸，如果這些部位的小間質(zhì)瘤或微小間質(zhì)瘤長大以后手術(shù)會(huì)給患者的生活和工作以及經(jīng)濟(jì)方面帶來很大的困難，所以要積極的處理，還有一部分小間質(zhì)瘤的核分裂象大于五個(gè)每五十個(gè)高倍視野，這些患者可能需要靶向藥物治療。

伊馬替尼治療胃腸道間質(zhì)瘤存在很多爭議。它的療效還是比較好的，比如伊馬替尼治療胃腸道間質(zhì)瘤的實(shí)現(xiàn)的問題，對(duì)一個(gè)中高危危險(xiǎn)度的胃腸道間質(zhì)瘤患者，口服伊馬替尼一年、三年，還是五年，當(dāng)然口服格列維三年的患者五年的復(fù)發(fā)率和生存率明顯好于一年的患者，這些患者一直吃下去，還是吃三年就正好，這現(xiàn)在是一個(gè)爭議的問題，我們國家和一些歐美的國家正在開展大規(guī)模的臨床事業(yè)，觀察三年-五年口服靶向治療藥物的患者和口服三年的患者的療效進(jìn)行比較，還有靶向治療藥物的適應(yīng)癥的問題，低危的患者，還有一些中危的患者，是否要口服靶向治療藥物，胃腸道間質(zhì)瘤破裂的患者是把他當(dāng)作復(fù)發(fā)的患者進(jìn)行終身的服藥，還是當(dāng)做高危的患者，服用三年、五年就可以，這需要臨床觀察。

胃腸道間質(zhì)瘤的危險(xiǎn)度評(píng)估目前用的還是2008年的NIH分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)，主要包括腫瘤的部位、腫瘤的大小、核分裂象以及腫瘤是否破裂。以胃的為例，腫瘤＜2cm，核分裂象每五十個(gè)高倍視野小于五個(gè)，這屬于低危危險(xiǎn)；腫瘤介于2-5cm之間，核分裂象大于五個(gè)的，以及腫瘤介于5-10cm之間，核分裂象每五十個(gè)高倍視野小于五個(gè)的，屬于中危險(xiǎn)度；對(duì)于胃的間質(zhì)瘤＞10cm，或者是核分裂象大于五個(gè)每高倍視野的，都屬于高復(fù)發(fā)危險(xiǎn)度。對(duì)于任何一個(gè)胃的間質(zhì)瘤，如果術(shù)中破裂都認(rèn)為是高危險(xiǎn)度的。